Présenté le 10 février 2016, le rapport annuel recommande une clarification des consignes de tri (harmonisation des couleurs des bacs, du tri, des logos liés au tri sur les produits), la modernisation des centres de tri (réduction du nombre et amélioration de la performance) et un renforcement de la transparence des coûts pour les collectivités. Selon le principe de "responsabilité élargie des producteurs", des industriels ont mis en place des éco-organismes depuis les années 1990 et la Cour des comptes en a étudié 14 sur 24 pour ce rapport. Parmi eux, Eco-Emballages/Adelphe a géré 763 millions d’euros en 2013. La Cour estime que les objectifs sont "diversement atteints" par les éco-organismes en matière de collecte et de valorisation et qu’ils sont d’une ambition telle que les acteurs doivent se mobiliser fortement. Pour les filières emballages ménagers et déchets électriques et électroniques, la Cour juge les objectifs impossibles à atteindre.